Chrno Crusade se passe à New York en l'année 1928, c'est l'histoire de Rosette Christopher, une soeur de l'ordre Magdaleine et de Chrno, le démon énigmatique. Rosette étant exorsiste, tout deux parcourts mille et un dangers pour exterminer les démons qui attaques les humains. Ils n'endurent ces efforts que pour retrouver Joshua, le petit frère de Rosette, enlevé il y a quelque années par le démon Aion. Ils rencontreront plus tard Azmaria, celle-ci est en fait un apotre de Dieu. C'est à dire quelqu'un ayant reçu le pouvoir de guérir les gens sans pouvoir guérir ses propres maux.