Samourai champloo, c'est l'histoire d'une jeune fille Fuu-chan, et de deux jeunes hommes, Mugen et Jin. Ils se rencontrent dans une maison de thé. Les deux hommes se battent mais ne peuvent finir leur combat car ils se font arrêter. La fille Fuu-chan les libère et leur fait promettre de l'aider a trouver un samourai qui sent les tournesol.